停产整治期间员工的工资支付问题，主要受《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定调整，而非单纯的行政法问题。根据《工资支付暂行规定》第十二条及各地具体规定，非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，用人单位应按劳动合同规定的标准支付工资。超过一个工资支付周期的，若劳动者提供了正常劳动，则支付给劳动者的劳动报酬不得低于当地最低工资标准；若劳动者没有提供正常劳动，应按国家有关规定办理（通常由各地规定，如支付生活费）。因此，企业因环保处罚停产，属于“非劳动者原因”的停工。企业不能以此为由随意解除劳动合同或停发工资。建议企业与员工协商，安排待岗、培训或协商解除合同并支付经济补偿。行政机关的停产整治决定本身不直接规定工资支付，但企业需依法承担作为用人单位的相应责任。