征收部门仅以“无证”为由简单将房屋认定为违法建筑并压低或不予补偿的做法，通常是不合法、不合理的。根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十四条及国务院办公厅、最高人民法院的相关指导意见精神，对征收范围内未经登记的建筑，市、县级人民政府应当组织有关部门依法进行调查、认定和处理。对认定为合法建筑和未超过批准期限的临时建筑的，应当给予补偿；对认定为违法建筑和超过批准期限的临时建筑的，不予补偿。认定时，必须充分考虑历史原因、建造时间、当时法律法规、政策背景以及当事人是否具有过错等因素。对于因历史原因形成的、符合当时建房条件或政策、只是手续不全的房屋，不应简单认定为违法建筑。您的维权策略：1. 要求征收方出具书面的调查认定结论及依据。2. 收集能证明房屋建造年代、历史背景、长期居住使用等事实的证据（如老照片、邻居证言、历年缴纳水电费单据、基层组织证明等）。3. 如果被认定为违建，及时针对该认定行为本身申请行政复议或提起行政诉讼。4. 在征收补偿协商中，明确提出房屋应视为合法或应予合理补偿的理由和证据。5. 若无法达成补偿协议，在收到征收补偿决定后，务必在法定期限内（收到决定书之日起60日内复议，6个月内诉讼）启动法律程序，切勿消极等待。核心是证明房屋的合法性或历史成因，打破“无证即违建”的片面认定。