公司不能随意扣发工资，但可主张赔偿。根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日书面通知可解除合同；在试用期内提前三日通知。员工未提前通知或未满通知期即离职，属于违法解除劳动合同。1. **工资支付**：公司必须支付其已工作期间的工资，扣发工资违法（《工资支付暂行规定》第九条）。2. **损失赔偿**：根据《劳动合同法》第九十条，劳动者违法解除劳动合同，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。公司需举证证明因员工未交接造成的直接经济损失（如项目停滞、客户流失的量化损失）。3. **实操建议**：首先发函要求其履行交接义务；其次，可暂缓办理离职手续（如开具离职证明）直至完成交接，但注意不得扣押档案或社保关系；最后，就赔偿事宜协商或仲裁。规章制度中明确交接流程和赔偿责任有助于管理。