该协议通常对村民不发生法律效力。根据《土地管理法》及《民法典》，宅基地使用权和房屋所有权属于村民个人或家庭，村委会无权在未获得权利人明确授权的情况下代为处分。有效的处分行为必须基于权利人的真实意思表示。村委会若未经村民会议或村民代表会议合法决议授权，或未取得每户村民的单独、明确的书面委托，其签订的协议属于无权代理。根据《民法典》第一百七十一条，无权代理行为未经被代理人追认，对被代理人不发生效力。村民可以主张该协议无效，并要求追究村委会及相关方的责任。村民应尽快书面声明反对该协议，并收集好宅基地使用权证、房产证、协议文本等证据，通过乡镇政府监督、行政投诉或诉讼等方式维权。