能否按商铺补偿，取决于该房屋的合法用途性质。根据规定，补偿依据是房屋权属证书登记的性质。如果产权证登记为“住宅”，则原则上按住宅补偿。但对于“住改非”（住宅改为经营性用房）房屋，各地通常有特别规定。一般需满足：在征收决定公告前已取得合法有效的营业执照、税务登记证并持续经营一定年限（如一年或两年）、且房屋是经营者的唯一经营场所。符合条件的话，可以在住宅补偿的基础上，增加一定比例的营业损失补偿，或参照商业用房评估的一定比例进行补偿。您需要提供营业执照、纳税凭证、经营流水等证据。具体补偿办法需查看当地的征收补偿方案实施细则。