保护软件知识产权需采取“组合拳”策略：
1. **著作权保护（核心）**：软件作为“计算机软件作品”自动受《著作权法》保护，自创作完成之日起产生。
- **登记作用**：虽然自动保护，但进行“计算机软件著作权登记”（国家版权局）具有重要实务价值：它是权属的初步证明，在发生侵权纠纷时，可简化举证责任；便于进行软件产品登记、税收优惠申请和技术交易。
- **登记材料**：需提交源代码、文档等。
2. **专利保护**：如果软件包含具有技术效果的创新性方法或流程（如一种新的图像处理算法），可考虑申请“发明专利”。专利保护力度强，但授权标准高、审查周期长。软件界面设计（GUI）可申请外观设计专利。
3. **商业秘密保护**：对于核心源代码、算法、技术文档等，可将其作为商业秘密保护。这要求公司采取合理的保密措施，如：
- 与涉密员工签订《保密协议》。
- 对源代码进行物理和电子隔离、加密。
- 建立分级访问权限制度。
- 在相关合同（如委托开发合同）中明确保密条款。
4. **商标保护**：为软件名称、Logo申请注册商标（第9类、第42类等），防止他人使用相同或近似名称进行混淆。
**综合建议**：
- **立即进行软著登记**，这是成本最低、见效最快的确权方式。
- **厘清权利归属**：如果是委托外部团队开发，必须在合同中明确约定“软件著作权归委托方（公司）所有”，否则根据《著作权法》，权利可能归受托方。
- **建立内部IP管理制度**，将上述保护措施制度化。