合同中关于工期、质量、保修等实质性条款，在合同无效后，其约定本身不再具有合同约束力。但是，这些约定可以作为确定双方过错、损失大小以及折价补偿计算标准的参考依据。例如，工期延误造成的损失，可参照合同约定的违约金标准或实际损失计算；工程质量标准，应至少符合国家强制性标准。根据《民法典》第七百九十三条，建设工程施工合同无效，但是建设工程经验收合格的，可以参照合同关于工程价款的约定折价补偿承包人。对于其他方面的责任划分，仍需结合双方过错、实际履行情况等因素综合判定。